Bacterias y el gen 16S

El gen que codifica para la subunidad 16S del ARN ribosomal es utilizado por todos nosotros como gen marcador para catalogar a las bacterias en grupos. El gen 16S contiene aproximadamente 1,500 nucleótidos y es particularmente útil para la clasificación de bacterias porque esta presente en todas las bacterias conocidas y además porque contiene regiones variables y altamente variables. Estas regiones variables nos permiten diferenciar entre diferentes tipos de bacterias, por ejemplo algunas bacterias podrían tener AGTACC en una determinada región, mientras que otras bacterias podrían tener GAAATT en la misma región.

Con esta información, quizás resulte lógico para ti pensar que si dos bacterias contienen exactamente la misma secuencia de nucleótidos en sus genes 16S, entonces estas bacterias pertenecerían al mismo grupo. Sin embargo, esto no es tan sencillo. El hecho de que nos sirvan los genes marcadores para catalogar microorganismos no implica que sean perfectos para tales propósitos.

Jaspers y Overmann publicaron un artículo en el 2004 (liga al articulo) donde muestran que se pueden encontrar secuencias de genes 16S idénticas en bacterias con genomas y ecofisiologías altamente divergentes. Lo más sorprendente de todo esto es que la mayoría de los autores que han usado el gen 16S para catalogar bacterias escriben (o escribimos) como si intentáramos ignorar esta realidad. Secuencias del gen 16S parecidas no necesariamente implican similitud biológica.