Cuando la gente me pregunta que hago, para algunos les resulta extraño o sorprendente cuando les digo que estudio microorganismos con métodos moleculares y computacionales. No estoy seguro exactamente como las personas piensan o se imaginan que estudiamos a los microorganismos, pero muchos parecen tener mucha dificultad para ver la conexión entre microorganismos, computadores y software.
Los primeros estudios acerca de la naturaleza y funciones de los microorganismos se llevaron a cabo utilizando métodos tradicionales de cultivo. Estos métodos consisten en tomar una muestra (por ejemplo, un hisopado bucal) y colocar los contenidos de esa muestra en un medio conteniendo los nutrientes necesarios para que crezca vida (por ejemplo, una fuente de energía). En algunas horas, días, semanas o incluso más tiempo, se podrá observar algunas colonias de microorganismos que crecieron gracias a los nutrientes contenidos en el medio proporcionado. Estos métodos tradicionales de cultivo son utilizados aun en la actualidad para estudiar ciertos aspectos de los microorganismos. Sin embargo, es nuestra opinión, más o menos consensada a nivel mundial, que las comunidades microbianas cultivables tienen una utilidad muy limitada en la ecología microbiana medioambiental contemporánea (liga a articulo acerca de esto).
¿Qué harías si alguien te dijera esto y tu aun tienes el deseo de estudiar microorganismos en sus ambientes naturales? Este tema es asunto aparte pero brevemente te comento que hoy en día secuenciamos genes (en otras palabras, determinamos el orden de nucleótidos en ciertas regiones del genoma) de microorganismos y utilizamos esas secuencias para inferir ciertos aspectos de esos microorganismos. Estas secuencias ultimadamente se convierten en letras contenidas en archivos, y es por esto que hoy en día dependemos por completo de computadoras y software para estudiar a los microorganismos. Aquí puedes encontrar una lista de herramientas computacionales que utilizamos para estudiar microorganismos.
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