Metano, Archaeas y calentamiento global

El metano es un compuesto orgánico cuya fórmula quimica es CH4. El metano es producido única y exclusivamente por miembros del dominio Archaea. Es interesante notar que algunos autores aun mencionan metanogenesis bacteriana en sus publicaciones (más de esto en Micro-Library).

El tema del metano y otros gases de efecto invernadero es importante en un contexto de calentamiento global y cambio climático. Los ruminantes poseen una gran cantidad de microorganismos dentro de su aparato digestivo. En el rumen, el cual sirve como cámara de fermentación, existe una población importante de Archaeas de las cuales algunas especies son productoras de metano. Debido a estos microorganismos, los rumiantes y otras especies animales de consumo se han puesto bajo la lupa de críticas internacionales debido a su contribución al calentamiento global.

No escribo esto para intentar convencer a nadie de nada. Existen una gran cantidad de artículos científicos y no científicos que tratan el tema (buen ejemplo aquí). Un artículo de revisión publicado recientemente en la revista Animal ofrece una perspectiva interesante acerca de la producción de metano en herbívoros mamíferos. Entre otras cosas, los autores mencionan que "a diferencia de afirmaciones anteriores, las emisiones absolutas de CH4 aumentaron linealmente a la ingesta de materia seca (MS), y los rendimientos de CH4 (por MS o ingesta de energía bruta) no variaron significativamente con la masa corporal". El paper se encuentra disponible gratuitamente.

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Bacterias y el gen 16S

El gen que codifica para la subunidad 16S del ARN ribosomal es utilizado por todos nosotros como gen marcador para catalogar a las bacterias en grupos. El gen 16S contiene aproximadamente 1,500 nucleótidos y es particularmente útil para la clasificación de bacterias porque esta presente en todas las bacterias conocidas y además porque contiene regiones variables y altamente variables. Estas regiones variables nos permiten diferenciar entre diferentes tipos de bacterias, por ejemplo algunas bacterias podrían tener AGTACC en una determinada región, mientras que otras bacterias podrían tener GAAATT en la misma región. Con esta información, quizás resulte lógico para ti pensar que si dos bacterias contienen exactamente la misma secuencia de nucleótidos en sus genes 16S, entonces estas bacterias pertenecerían al mismo grupo. Sin embargo, esto no es tan sencillo. El hecho de que nos sirvan los genes marcadores para catalogar microorganismos no implica que sean perfectos para tales prop...

¿Quién es Akkermansia?

Akkermansia fue el nombre otorgado por Muriel Derrien et al. en el 2004 a una nueva bacteria aislada de una muestra fecal de un individuo adulto sano. Las células de esta nueva bacteria tenían forma de ovalo, no presentaron motilidad, y se tiñeron como gram negativas. Esta nueva bacteria también mostró ser estrictamente anaeróbica, quimio-organotrofica, y mucolítica en cultivo puro. Fui presentado formalmente con Akkermansia en el 2014 en un artículo con la Dra. Giuliana Noratto evaluando el efecto del jugo de durazno y ciruela en la microbiota intestinal de ratas Zucker obesas. Más tarde, y también gracias a Giuliana, en el 2016 mostramos tanto con secuenciación masiva como con PCR cuantitativo, que ratones obesos tenían menos Akkermansia en comparación con ratones no obesos, y que el consumo de trigo integral ayudó a disminuir aún más la abundancia de esta bacteria. También mencioné en ese entonces que era importante tener en cuenta que "una mayor abundancia en las hec...

Microbios nativos y microbios adquiridos

Quizás soy raro, pero si alguien me dijera que cientos de miles de microorganismos habitan normalmente dentro de mi aparato digestivo, creo que es muy congruente y lógico preguntar el origen de esos microorganismos. ¿De dónde provienen originalmente? ¿Vienen en los alimentos que consumo todos los días? ¿O al momento de nacer fui "infectado" por los microbios en la sala de parto? Ultimadamente, ¿cómo terminaron conmigo? Estas preguntas son de mucho valor para todos aquellos como yo que nos fascina la evolución. La pregunta de si los microorganismos presentes en algún ambiente (aparato digestivo, suelos, océanos) son realmente nativos de ese ambiente, no es para nada sencillo de contestar con precisión. Debido a que los microorganismos han habitado la Tierra desde sus inicios, es importante admitir que todos los microorganismos que habitan en nosotros tienen que, forzosamente, ser descendientes de microorganismos del medio ambiente. Sin embargo, durante el curso de la...

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