Microorganismos

Analizando 16S sequencing data con ISME, QIIME2, y Texas A&M University. ISME son las siglas en inglés de la Sociedad Internacional para la Ecología Microbiana. Mi relación con ISME se remonta poco después de terminar mi doctorado en Texas A&M University cuando en el 2014 visité la ciudad de Seúl, en Corea del Sur, para participar en  ISME15 . En este simposio, tuve la oportunidad de conocer en persona a mucha gente, incluyendo algunos colegas de los cuales solamente conocía sus publicaciones. En este evento, un Profesor del cual no recuerdo su nombre me dijo: "Para mis estudiantes es importante que sepan que si les apasionan los microorganismos, entonces les tiene que gustar las computadoras". De acuerdo, y me permito ofrecer un buen ejemplo. Estoy analizando en este momento datos de secuenciación masiva de una pequeña sección del gen que codifica para la subunidad 16S del ARN ribosomal. Estos datos no son nada más que secuencias genéticas (escritas e

Akkermansia fue el nombre otorgado por Muriel Derrien et al. en el 2004 a una nueva bacteria aislada de una muestra fecal de un individuo adulto sano. Las células de esta nueva bacteria tenían forma de ovalo, no presentaron motilidad, y se tiñeron como gram negativas. Esta nueva bacteria también mostró ser estrictamente anaeróbica, quimio-organotrofica, y mucolítica en cultivo puro. Fui presentado formalmente con Akkermansia en el 2014 en un artículo con la Dra. Giuliana Noratto evaluando el efecto del jugo de durazno y ciruela en la microbiota intestinal de ratas Zucker obesas. Más tarde, y también gracias a Giuliana, en el 2016 mostramos tanto con secuenciación masiva como con PCR cuantitativo, que ratones obesos tenían menos Akkermansia en comparación con ratones no obesos, y que el consumo de trigo integral ayudó a disminuir aún más la abundancia de esta bacteria. También mencioné en ese entonces que era importante tener en cuenta que "una mayor abundancia en las hec

Desde que comencé mis estudios de Doctorado en la Universidad de Texas A&M en el 2008, y particularmente desde mi primer aparición en una publicación científica arbitrada en el 2010, he tenido el honor de haber podido colaborar con una gran variedad de científicos y no científicos en mejorar nuestro entendimiento de la microbiota presente en varios ecosistemas, particularmente dentro del aparato digestivo de humanos y otros mamíferos. Los esfuerzos científicos son, sin ninguna duda, trascendentales para el desarrollo de nuestra especie en nuestro Planeta.  El Síndrome de Intestino Irritable (abreviado como SII) es un trastorno funcional caracterizado por dolor o malestar abdominal que se asocia con alteraciones del hábito intestinal y con otros síntomas gastrointestinales como distensión y sensación de inflamación abdominal, evacuación incompleta, urgencia, pujo y tenesmo (ver Carmona-Sánchez et al. 2016 ). De acuerdo con este artículo, la prevalencia (definida como la prop