Microorganismos

Quizás soy raro, pero si alguien me dijera que cientos de miles de microorganismos habitan normalmente dentro de mi aparato digestivo, creo que es muy congruente y lógico preguntar el origen de esos microorganismos. ¿De dónde provienen originalmente? ¿Vienen en los alimentos que consumo todos los días? ¿O al momento de nacer fui "infectado" por los microbios en la sala de parto? Ultimadamente, ¿cómo terminaron conmigo? Estas preguntas son de mucho valor para todos aquellos como yo que nos fascina la evolución. La pregunta de si los microorganismos presentes en algún ambiente (aparato digestivo, suelos, océanos) son realmente nativos de ese ambiente, no es para nada sencillo de contestar con precisión. Debido a que los microorganismos han habitado la Tierra desde sus inicios, es importante admitir que todos los microorganismos que habitan en nosotros tienen que, forzosamente, ser descendientes de microorganismos del medio ambiente. Sin embargo, durante el curso de la...

Cuando la gente me pregunta que hago, para algunos les resulta extraño o sorprendente cuando les digo que estudio microorganismos con métodos moleculares y computacionales. No estoy seguro exactamente como las personas piensan o se imaginan que estudiamos a los microorganismos, pero muchos parecen tener mucha dificultad para ver la conexión entre microorganismos, computadores y software. Los primeros estudios acerca de la naturaleza y funciones de los microorganismos se llevaron a cabo utilizando métodos tradicionales de cultivo. Estos métodos consisten en tomar una muestra (por ejemplo, un hisopado bucal) y colocar los contenidos de esa muestra en un medio conteniendo los nutrientes necesarios para que crezca vida (por ejemplo, una fuente de energía). En algunas horas, días, semanas o incluso más tiempo, se podrá observar algunas colonias de microorganismos que crecieron gracias a los nutrientes contenidos en el medio proporcionado. Estos métodos tradicionales de cultivo son ut...

Mi familia ha adoptado varios perros callejeros, entre ellos el Pinto. Quiero admitir que tengo una relación estrecha con ellos, llego del trabajo y juego con ellos pretendiendo que soy parte de la jauría. Hoy por la mañana descubrí que mi perro Pinto se pudo meter a la casa y orino mi mochila de ISME17 , nuevamente. De todas las cosas que hay dentro de mi casa, Pinto parece tener una particular predilección por mi mochila. Esto me hizo pensar en varias cosas (por ejemplo, no dejar la puerta del patio entreabierta), incluyendo una serie de publicaciones que apuntan a una relación estrecha entre la microbiota de nosotros los seres humanos y la microbiota de nuestras mascotas. Song et al. publicaron en el 2013 los resultados de una investigación acerca de este importante tema. Los autores recolectaron muestras de microbiota oral, fecal y de la piel de un total de 60 familias junto con la microbiota de sus perros. Entre otras cosas, los autores mostraron que los miembros de una mis...

En una plática en el TEC de Monterrey a mediados de Noviembre del 2019 acerca de microbios y medicina personalizada, los estudiantes me hicieron varias preguntas que me intrigaron. Pero hubo una en lo particular que me resulto ser de lo más interesante. Al hablar acerca de que cada individuo posee una microbiota única y diferente a la microbiota de todos los demás seres humanos, una estudiante preguntó que porque los microorganismos eran diferentes entre ellos. En su mente, tenía más sentido pensar que todos los individuos estaban habitados por los mismos tipos de microorganismos, en vez de pensar que cada individuo posee sus propios tipos de microorganismos. Después de varios días, pensé que quizás alguna analogía podría servir para ejemplificar mejor este asunto. Pensemos por un momento que todas y cada una de las pequeñas rocas que podemos encontrar en una montaña, digamos el Cerro de la Silla. Si analizas estas rocas, te darás cuenta de que cada una es diferente. Y si analiz...

El gen que codifica para la subunidad 16S del ARN ribosomal es utilizado por todos nosotros como gen marcador para catalogar a las bacterias en grupos. El gen 16S contiene aproximadamente 1,500 nucleótidos y es particularmente útil para la clasificación de bacterias porque esta presente en todas las bacterias conocidas y además porque contiene regiones variables y altamente variables. Estas regiones variables nos permiten diferenciar entre diferentes tipos de bacterias, por ejemplo algunas bacterias podrían tener AGTACC en una determinada región, mientras que otras bacterias podrían tener GAAATT en la misma región. Con esta información, quizás resulte lógico para ti pensar que si dos bacterias contienen exactamente la misma secuencia de nucleótidos en sus genes 16S, entonces estas bacterias pertenecerían al mismo grupo. Sin embargo, esto no es tan sencillo. El hecho de que nos sirvan los genes marcadores para catalogar microorganismos no implica que sean perfectos para tales prop...

Por mucho tiempo se utilizó el termino "microflora" para referirse a una comunidad de microorganismos, por ejemplo a la microbiota intestinal. Este termino incluso apareció en el titulo de un articulo científico famoso publicado en la revista Science en el 2005 ( liga al articulo ). Es fecha de que aun algunos utilizan este termino, pero pocos han sido los que se detienen para explicarle a colegas y al público en general las razones detrás del porque el termino es incorrecto y no debería utilizarse. Sin afán de aburrir a nadie, los microorganismos fueron descubiertos en la segunda mitad del siglo XVII y fueron llamados "animaculos" o pequeños animales. Es incierto, de alguna manera, como cambiaron las cosas de pequeños animales a pequeñas plantas, pero tan tarde como 1905 (300 años después del descubrimiento de los microorganismos!) algunos investigadores (por ejemplo Mutchler) todavía se referían a las bacterias como las plantas más simples. Todavía más sorpr...