Microorganismos

  Antes que nada, muchas felicidades a todos los maestros y maestras de México y del mundo! Hace tiempo que no me sentaba a escribir en este blog, y me gustaría aprovechar este día para nuevamente escribir algunas de mis opiniones como científico, ser humano, y también como maestro. En algunas partes de México han comenzado ya las clases presenciales, despues de más de 1 año de haber cerrado la educación presencial, supuestamente por la seguridad de los maestros y estudiantes. En este respecto, quizás te sorprendería saber que nunca hubo necesidad de cerrar las escuelas! Si bien es cierto que existen algunos virus y microorganismos capaces de enfermar a los seres humanos y a otros mamíferos, también es cierto que esto representa un mecanismo natural donde las diferentes formas de vida tratan de sobrevivir. Siempre ha sido así y siempre será así.  El regreso a clases presenciales se esta estableciendo bajo normas y regulaciones sanitarias que no tienen ningún sentido médico ni ...

  La cavidad oral de los seres humanos y otros animales representa el inicio del sistema digestivo y esta habitada por millones de microorganismos. No importa que tan limpia creas que tienes tu boca, muchos microorganismos habitan ahí de manera natural. Uno de los primeros estudios que analizó la microbiota oral usando métodos moleculares (a diferencia de las técnicas de cultivo) utilizó la técnica de biblioteca de clones y demostró que "existe una flora bacteriana predominante distintiva de la cavidad bucal sana que es muy diversa y específica para el sitio y el sujeto" ( Aas et al. 2005 en el Journal of Clinical Microbiology). A partir de esta publicación, muchos otros estudios y bases de datos han sido publicadas acerca de este fascinante tema (ver por ejemplo The Human Oral Microbiome publicado en el 2010).  El objetivo de este post no es discutir acerca de las medidas irracionales y sin fundamento para supuestamente disminuir la cantidad de "contagios" (perdó...

En la practica de la medicina, tanto en humanos como en animales, es común el uso de microorganismos para ayudar a sanar, o bien, para mantener la salud. Esto proviene de una larga y magnífica historia que se remonta incluso a tiempos antes de la famosa publicación de  Elie Metchnikoff "The prolongation of life". Estos microorganismos son conocidos generalmente como probioticos y se definen como "microorganismos viables los cuales cuando son consumidos en cantidades adecuadas pueden conferir un beneficio en la salud". Y una de las preguntas que surgen frecuentemente acerca de este tema, es precisamente acerca de cuantas exactamente son esas "cantidades adecuadas" de probióticos que se necesitan ingerir para promover la salud. Antes de comentar cualquier otra cosa, es importante que conozcas la cantidad de microorganismos presentes de manera natural en tu intestino y los intestinos de otros mamíferos. Esto varía grandemente dependiendo de la locación...

Buscando una buena imagen para "Dysbiosis" me apareció la imagen de arriba. La imagen estaba asociada con una nota de Thailand Medical News titulada "Study Confirms Gut Microbiota Imbalance (Dysbiosis) Linked To Onset Of Colorectal Cancer" y la puedes encontrar en esta liga . Te guste o no, tu aparato digestivo se encuentra habitado permanentemente por una comunidad compleja de Bacterias y otros microorganismos conocida por nosotros los científicos como "la microbiota gastrointestinal". Esta microbiota es indispensable para mantener tu salud, es altamente individualizada, y en condiciones en las cuales el hospedero (o sea, tú o yo) goza de salud, se dice que se encuentra en un proceso de equilibro, o también conocido como normobiosis.  El término disbiosis se refiere, supuestamente, a un estado opuesto a la normobiosis, o sea de imbalance en la microbiota. Por mucho tiempo, la disbiosis ha sido un importante concepto de organización en la ciencia de...

Analizando 16S sequencing data con ISME, QIIME2, y Texas A&M University. ISME son las siglas en inglés de la Sociedad Internacional para la Ecología Microbiana. Mi relación con ISME se remonta poco después de terminar mi doctorado en Texas A&M University cuando en el 2014 visité la ciudad de Seúl, en Corea del Sur, para participar en  ISME15 . En este simposio, tuve la oportunidad de conocer en persona a mucha gente, incluyendo algunos colegas de los cuales solamente conocía sus publicaciones. En este evento, un Profesor del cual no recuerdo su nombre me dijo: "Para mis estudiantes es importante que sepan que si les apasionan los microorganismos, entonces les tiene que gustar las computadoras". De acuerdo, y me permito ofrecer un buen ejemplo. Estoy analizando en este momento datos de secuenciación masiva de una pequeña sección del gen que codifica para la subunidad 16S del ARN ribosomal. Estos datos no son nada más que secuencias genéticas (escritas e...

Akkermansia fue el nombre otorgado por Muriel Derrien et al. en el 2004 a una nueva bacteria aislada de una muestra fecal de un individuo adulto sano. Las células de esta nueva bacteria tenían forma de ovalo, no presentaron motilidad, y se tiñeron como gram negativas. Esta nueva bacteria también mostró ser estrictamente anaeróbica, quimio-organotrofica, y mucolítica en cultivo puro. Fui presentado formalmente con Akkermansia en el 2014 en un artículo con la Dra. Giuliana Noratto evaluando el efecto del jugo de durazno y ciruela en la microbiota intestinal de ratas Zucker obesas. Más tarde, y también gracias a Giuliana, en el 2016 mostramos tanto con secuenciación masiva como con PCR cuantitativo, que ratones obesos tenían menos Akkermansia en comparación con ratones no obesos, y que el consumo de trigo integral ayudó a disminuir aún más la abundancia de esta bacteria. También mencioné en ese entonces que era importante tener en cuenta que "una mayor abundancia en las hec...

Desde que comencé mis estudios de Doctorado en la Universidad de Texas A&M en el 2008, y particularmente desde mi primer aparición en una publicación científica arbitrada en el 2010, he tenido el honor de haber podido colaborar con una gran variedad de científicos y no científicos en mejorar nuestro entendimiento de la microbiota presente en varios ecosistemas, particularmente dentro del aparato digestivo de humanos y otros mamíferos. Los esfuerzos científicos son, sin ninguna duda, trascendentales para el desarrollo de nuestra especie en nuestro Planeta.  El Síndrome de Intestino Irritable (abreviado como SII) es un trastorno funcional caracterizado por dolor o malestar abdominal que se asocia con alteraciones del hábito intestinal y con otros síntomas gastrointestinales como distensión y sensación de inflamación abdominal, evacuación incompleta, urgencia, pujo y tenesmo (ver Carmona-Sánchez et al. 2016 ). De acuerdo con este artículo, la prevalencia (definida como la ...